Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
COG3Q96JB2 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 675.3 ms