Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PRKCHP24723 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms