Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS45-202ENST00000369130 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000552.1-201ENST00000447720 3215 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF415-202ENST00000421033 2402 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NME6-205ENST00000421967 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CABLES1-203ENST00000420687 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRADA-253ENST00000640979 2086 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 THPO-201ENST00000204615 1855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPP3-202ENST00000398393 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL451074.1-201ENST00000400982 1216 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031667.2-201ENST00000423903 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRSS3-204ENST00000429677 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1QTNF9-AS1-201ENST00000449656 470 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms