Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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PTPRMP28827 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PTPRMP28827 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
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