Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA3Q9Y6Q9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCOA3Q9Y6Q9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms