Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C3Q9Y5Q9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms