Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAD54L2Q9Y4B4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms