Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFE2L3Q9Y4A8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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