Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRRAPQ9Y4A5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms