Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9Y3F1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms