Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
UTP11Q9Y3A2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UTP11Q9Y3A2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms