Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOP58Q9Y2X3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOP58Q9Y2X3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms