Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms