Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP20Q9Y2K6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP20Q9Y2K6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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