Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTNND2Q9UQB3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms