Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHOC2Q9UQ13 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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