Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAK1Q9UPV9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms