Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TNFSF18Q9UNG2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms