Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND2AQ9ULE3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms