Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C4Q9UKN8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C4Q9UKN8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms