Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXL4Q9UKA2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FBXL4Q9UKA2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms