Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL4Q9UJQ4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms