Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPUSD1Q9UJJ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPUSD1Q9UJJ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms