Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms