Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MLH3Q9UHC1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MLH3Q9UHC1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms