Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms