Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NKX1-2Q9UD57 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX1-2Q9UD57 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms