Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNAL1Q9UBT7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms