Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCLA2Q9P2R7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms