Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms