Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C9orf78Q9NZ63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms