Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC28Q9NX36 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms