Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ASF1BQ9NVP2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms