Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPRMQ9NS64 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms