Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTPS2Q9NRF8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms