Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAJC4Q9NNZ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms