Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD3Q9H7B4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms