Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRDM12Q9H4Q4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM12Q9H4Q4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms