Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLSTN2Q9H4D0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms