Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDCL3Q9H2J4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms