Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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FOXQ1Q9C009 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXQ1Q9C009 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXQ1Q9C009 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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