Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDEM3Q9BZQ6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDEM3Q9BZQ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms