Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRRTQ9BXP5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms