Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL3Q9BXA9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL3Q9BXA9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms