Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPOQ9BU64 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPOQ9BU64 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms