Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSEN34Q9BSV6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSEN34Q9BSV6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms