Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GINS3Q9BRX5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms