Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms