Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOPXQ9BPY8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOPXQ9BPY8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms