Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VGLL1Q99990 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms